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Metabuli 기사 및 게시글 모음 2024년 5월 22일에 Metabuli 논문이 Nature Methods에 출판되었다.처음 제출하고 11개월이 걸렸지만, 그 기간 동안 Metabuli도 나도 더욱 성장할 수 있었다.논문 발표와 관련하여 보도된 기사나 홍보 게시물을 모아보았다.사실 보도 자료도 직접 작성한 것이고, 한빛사에 논문도 직접 등록하는 것이다. 스스로 홍보한 셈이지만, 홍보가 먹혀서 연구 결과에 주목을 받으니 뿌듯하고 신기한 느낌이다.4년 동안 혼자 숨겨 놓고 다듬고 있던 것을 세상에 내놓는 느낌.기사 목록1. 조선비즈: 링크 DNA·아미노산 동시에 분석해 감염병 진단 속도 높였다DNA·아미노산 동시에 분석해 감염병 진단 속도 높였다 마틴 스타이네거 서울대 생명과학부 교수 연구진 DNA로 바이러스 변이, 아미노산으로 새로운 감..
구분 1) 찰흙 한 덩이를 떠올려 보자. 동그랗고 말랑말랑한 찰흙 한 덩이. 그리고 그 덩이를 'A'라고 부르자. 이제 그 덩이를 반으로 갈라보자, 그러면 두 덩이가 생긴다. 둘 중에 어떤 게 'A'일까? 둘 다 'A' 일까? 둘 다 'A'가 아닐까? 아무래도 상관 없는 문제인가? 2) 이제 말랑말랑한 세포 하나를 떠올려 보자. 그 세포에게 이름을 붙여보자. 다시 그냥 'A' 라고 하자. 세포가 무럭 무럭 자라서 크기가 두 배가 되었다. 이제 분열을 해서 세포가 두 개가 되었다. 둘 중 어떤 게 'A'지? 둘 다 'A'인가? 둘 다 'A'가 아닌가? 3) 이제 다세포 생물을 떠올려 보자. 이름은 다세퐁이다. 세포 4개로 이루어진 아주 단순한 생물이다. 이 세포는 잘 크면 세포 4개 중 하나가 분열하여 세포 5..
남들이 보지 않던 것을 보자 최규하 교수님은 보기 어려워서 보지 않던 교차를 봤다. 오늘 연사님은 애기 장대에서 보지 않던 부피 생장을 봤다. 남들이 보지 않던 표현형/형질이 무엇인가. 기존의 모델 식물에선 전혀 볼 수 없는 형질도 있음을 유념하자. 모델 식물에 관찰의 폭을 좁히지 말라. 온 세상이 관찰 대상이다. 자세하게 보자.
우리가 빛의 속도로 갈 수 없다면 - 순례자들은 왜 돌아오지 않는가 "우리는 그곳에서 괴로울 거야 하지만 그보다 많이 행복할 거야" 괴로움은 분별에서 시작된다. 좋은 것과 나쁜 것을 분별하여, 좋은 것을 얻지 못하여 괴롭고 나쁜 것을 얻어 괴롭다. 나의 것과 남의 것을 분별하여, 소유하지 못 해 괴롭다. 옳은 것과 그른 것을 분별하여, 옳지 못해 스스로 괴롭고 그르다 하며 남을 괴롭힌다. 불교의 오래된 경전 숫타니파타에 이런 가르침이 나와있다. "어떤 것을 느낄 때 '좋아하는 것'을 두지 말며, 내가 좋아하는 것만 '하고 싶다'고 '매달리지' 마라. 내 마음이 무엇을 하는지 감정의 흐름을 끊임없이 경계해서, 이윽고 어떠한 것을 보더라도 '좋다'거나 '나쁘다'는 생각을 하지 않는 것을 '깨달았다'고 말한다." 좋은 것과 나쁜 것을 구분하지 않는 것. 즉, 분별심이 없는 상..
대학원생 때 알았더라면 좋았을 것들 파이만 알고리즘 1. 문제를 쓴다 2. 진짜 열심히 생각한다 3. 답을 쓴다 1번 과정이 핵심. 시험처럼 정해진 문제를 푸는 것이 아니다. 문제를 스스로 정하는 것이다. 풀어야할 문제를 구체적으로 특정하는 것이 중요하다. "잘못된 문제에 정확한 답을 찾기 위해서 헛수고를 하고있다." 공학 연구의 목표 기술 방법 4가지 1. 가설 H를 검정하는 것 2. 파라미터 P를 정확도 A로 측정하는 것 3. 추측 C를 증명하는 것 4. D분야의 M방법론을 E분야의 P문제를 풀기 위해 적용하는 것 연구주제에 대해 3단계로 말해보기 (당신은 무엇을 공부하고 있나요?) 1. 저는 X라는 주제에 대해 공부하고 있습니다. - 활동/작업 (왜 그 주제를 공부하고 있지요?) 2. 저는 왜 Y인지 알고 싶거든요. - 지식/목표 (..
[암 유전학] 2. 암의 유전적 기반 (작성 중) ▶ 암은 돌연변이가 축적되어 만들어진다. ▶ 암은 하나의 세포에서 시작된다.배경 지식(X chromose inactivation, barr body, 바소체) : 여성은 X염색체 두 개를 갖는다. 남성은 하나를 가지기 때문에, 여성이 두 배를 갖는 것이다. 이를 보완하기 위해, 두 개 중 하나는 비활성화된다. 비활성화는 초기 배아 단계에서 일어나며, 어떤 X염색체가 비활성화될지는 초기 배아의 세포마다 다르다. 그러나 일단 비활성화되면, 계속 유지되며 딸세포에서도 유지된다. 1번 X염색체가 비활성화된 세포가 분열하여 새로 생긴 세포는 모두 1번 X염색체가 비활성화되어있다는 것이다.실험 설명:여성 암 환자가 있다. 어떤 단백질은 A형태 또는 B형태를 가지는데, 이 환자의 1번 X염색체는 A단백질을 만들고, ..
[암 유전학] 1. 암세포의 특징 ▶ 통제되지 않은 세포의 성장/분열1. Autocrine stimulation:외부에서 growth factor나 호르몬이 보내는 신호에 따라 세포가 성장/분열해야 하는데,그렇지 않고 세포가 자기 자신에게 성장/분열 신호를 보냄 2. Contact inhibition이 없음:대부분의 일반 세포는 monolayer를 이루면 contact inhibition에 의해 분열을 멈춘다.그러나 암세포는 contact inhibition이 없어서 여러 층을 만들면서 계속 분열한다. 3. Progammed cell death가 없음:세포의 유전체가 큰 손상을 입으면 자살해버린다. 이를 apoptosis라고 한다.암세포는 apoptosis를 하지 않아서, 손상된 유전체를 가지고 계속 분열하고, 손상이 축적된다.▶ 많은 ..
생명과학 PPT 만드는 TIP 1. 슬라이드 제목은 슬라이드 내용을 요약하는 문장으로 쓸 것. 단어만 제시하지 말 것  2. 한 슬라이드에 그림을 최소 한 개 넣을 것, 두 개는 넘기지 말 것  - 논문의 그림을 가져올 경우, 그림의 제목을 슬라이드의 제목으로 사용하면 편함 3. 그림을 설명하는 간단한 글을 넣을 것. 글은 세 문장을 넘기지 말 것 4. 불가피하게 한 슬라이드에서 다루는 내용이 많다면, 애니메이션을 사용하여 단계별로 내용을 제시하여 청중의 시선을 필요한 곳에 집중시킬 것 5. 글씨는 무조건 잘 보여야 함 6. 흰 바탕에 검은 글씨, 빨간색/파란색의 강조 표시로 구성할 것. 7. 요약/강조하는 슬라이드를 반드시 넣을 것. 강조는 세 개 넘게 하지 말 것. 청중이 집중할 수 있는 건 최대 세 개.  8. 슬라이드 순서에 ..

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